新闻资讯

NEWS CENTER

新闻资讯

新闻资讯



留言咨询

与最新消息保存同步

* 留言内容：

* 单位：

* 姓名：

* 电话：

邮箱：

k8凯发(中国)

/

华盈视角

/

Allergy（IF: 12.4）| 肥胖相关的低2型哮喘特异性细胞外囊泡miRNA的鉴定

分类：华盈视角
作者：绿野
来源：标志物研究俱乐部

【概要描述】肥胖相关低2型哮喘特异性细胞外囊泡miRNA分析





Allergy（IF: 12.4）| 肥胖相关的低2型哮喘特异性细胞外囊泡miRNA的鉴定

【概要描述】肥胖相关低2型哮喘特异性细胞外囊泡miRNA分析

分类：华盈视角
作者：绿野
来源：标志物研究俱乐部
发布时间：2024-01-17 12:51
访问量：

详情

哮喘是下呼吸道的一种慢性炎症，根据主要的潜在免疫机制，主要分为2型哮喘和非/低2型哮喘两种亚型。血浆细胞外囊泡(EVs)是健康和疾病状态分子信息的重要来源，EVs携带的内容物可以预测疾病表型背后的特定病理机制。近期，一篇“Identification of extracellular vesicle microRNA signatures specifically linked to inflammatory and metabolic mechanisms in obesity-associated low type-2 asthma”的研究文章，在线发表在国际知名过敏及免疫学领域学术期刊Allergy（IF: 12.4）杂志上。研究人员通过进行EVs miRNA特征分析，确定了两个miRNA集：miR-17-92和miR-106a-363，它们与肥胖相关的低2型哮喘表型的炎症和代谢机制相关，该研究对低2型哮喘的潜在分子机制有了新的认识。

| 研究结果

1、EVs miRNA含量可区分肥胖/非肥胖低2型哮喘和健康受试者

选择肥胖低2型哮喘(OA，N=10)、非肥胖低2型哮喘(NOA，N=10)患者和健康受试者（Ctrl，N=10），分离血浆EVs并进行鉴定后开展miRNA测序分析。PCA和聚类分析结果显示三个组之间存在明显分离，哮喘组和对照组之间存在显著差异。

图1 血浆EVSs miRNA分析

2、炎症和代谢机制与肥胖低2型哮喘特异性EVs miRNA相关

OA组和NOA组与Ctrl组相比，分别有706个和636个差异表达miRNA，OA与NOA相比，存在679个独特miRNA，表明这两种哮喘表型之间存在显著的分子差异。为了阐明EVs miRNA与肥胖相关的低2型哮喘发展之间可能的分子机制，研究人员进行生物学途径和功能分析，发现在OA组中，细胞因子相关通路（如IL- 2、IL- 4等）、TGF-β信号通路、促炎细胞因子(IL- 6和IL- 1)等相关通路受影响显著，差异EVs miRNA相关的下游生物学功能包括细胞功能、衰老、造血、Akt通路调控和一些与肥胖相关的途径（如胰岛素、瘦素信号传导途径等）等。

图2 差异miRNA生物学途径与功能分析

3、miR-17-92和miR-106a- 363基因集与肥胖相关低2型哮喘表型相关性分析

?接下来，研究人员把功能和通路分析相同的差异miRNA纳入TAM 2.0数据库进行了miRNA集群分析，发现OA组有两个显著改变的miRNA集：miR-17- 92和miR-106a-363。根据miRNA的靶基因建立共表达基因网络，其中miR-17– 92集连接的基因与TGF-β信号传导、脂质和脂蛋白代谢途径等多种相关生物学途径相关，miR-106a-363集连接的基因与IL-2信号通路等相关。进一步，评估miRNA集与临床的关联性，Pearson相关系数分析发现两个miRNA集与BMI以及炎症标志物之间存在正相关，与肺功能参数呈负相关，提示EVs miRNA集与独特哮喘表型的炎症和临床状态有关。此外，ROC曲线分析显示miR-17-92和miR-106a–363集不仅可以将OA与健康对照组区分开来，还有区分两种哮喘表型的能力。

图3 肥胖相关的低2型哮喘显著富集的EVS miRNA集分析

4、OA患者血液EVs miRNA和血液CD4⁺T细胞中均富集干扰素(IFN)信号通路

之前一项基于相同研究人群的转录组研究发现OA组中IFN信号通路在CD4⁺T细胞中特异性上调。研究人员对两项研究的显著富集的生物途径进行UMAP分析，发现血浆EVs miRNA和CD4⁺T细胞转录组特征中有一些相似的生物学途径，如IFN信号传导和病毒感染，证实液体活检和血浆EVs miRNA谱在识别哮喘表型特定分子的作用，而这些特征在预先选择的循环细胞类型中难以检测到。

图4 EVs miRNA和血液CD4⁺T细胞生物途径分析

| 总结与讨论

在这项研究里，研究人员选取肥胖相关的低2型哮喘（OA）和非肥胖相关的低2型哮喘（NOA）患者和健康对照人群，分离血浆EVs并进行小RNA测序和生物信息学分析，发现三个研究组的EVs miRNA谱有明显区分。进一步对差异miRNA靶基因进行生信分析，发现炎症因子和代谢因子信号通路与OA特异性相关。miR-17-92和miR-106a-363在OA中显著富集，这些miRNA集不仅与临床指标和肺功能参数有相关性，还可以用于疾病的诊断区分。最后，研究人员还证实血浆EVs miRNA特征反映了血液来源的CD4⁺T细胞转录组数据。

k8凯发(中国)--血液标志物完整解决方案构建者

1）“蛋白芯片”和“蛋白质谱”双平台技术服务体系将完美助力于血液蛋白标志物的发现，双管齐下，最大限度的不漏筛低丰度的血液蛋白，发现最具临床意义的标志物。

2）“外泌体研究体系”可全面筛选血液外泌体中的RNA、蛋白、脂类等，针对外泌体微量体系，后续验证阶段k8凯发(中国)可提供提供超灵敏的检测技术，最大限度减少在大队列验证过程中数据缺失值的问题。目前华盈已经实现了外泌体“分离—鉴定—标志物筛选 —验证—建模”一站式服务体系。

3）“20k人类蛋白组芯片”包含大约2万多种人类蛋白，可全面筛选血液自身抗体，发现肿瘤、自身免疫疾病等新的自身抗体诊断标志物。

4）“ISOP单细胞功能蛋白组”可实现对单个细胞亚群的32种功能分泌蛋白组的检测，发现关键的多功能性细胞，作为肿瘤免疫治疗、CAR-T细胞治疗的预测标志物。

5） “单细胞表型蛋白组”利用质谱流式细胞术（CyTOF）可以支持全血样本、组织样本、单细胞悬液等多种样本类型的分析，抗体库包含常用的人源抗体500多种，鼠源抗体300多种，可以实现对细胞亚型、细胞功能的精准分析。

| 相关文献

Alhamdan F, et al. Identification of extracellular vesicle microRNA signatures specifically linked to inflammatory and metabolic mechanisms in obesity-associated low type-2 asthma. Allergy. 2023.

上一个: Cell子刊｜四医大研究团队发现线粒体多肽缓解非酒精性脂肪肝的直接互作靶点

下一个: Cancer Cell | PCF空间单细胞蛋白组鉴定三阴乳腺癌不同的治疗反应轨迹

上一个: Cell子刊｜四医大研究团队发现线粒体多肽缓解非酒精性脂肪肝的直接互作靶点

下一个: Cancer Cell | PCF空间单细胞蛋白组鉴定三阴乳腺癌不同的治疗反应轨迹